MangaLine Ediciones nació como marca vinculada a una revista especializada en manga creada por Miguel Ángel Díaz Saldaña en 1994, antes de convertirse en editorial propiamente dicha en mayo de 2001. Desde Sevilla, se incorporó a un mercado editorial todavía en expansión y destacó rápidamente por apostar por títulos que contribuyeron a ampliar la presencia del manga en España.
Durante aquella primera etapa publicó obras tan relevantes como Berserk (ベルセルク), de Kentaro Miura (三浦 建太郎), varias obras de Tsukasa Hōjō (北条 司), Angel Sanctuary (天使禁猟区), de Kaori Yuki (由貴 香織里), Please Save My Earth (ぼくの地球を守って), de Saki Hiwatari (日渡 早紀), o Saiyuki (最遊記), de Kazuya Minekura (峰倉 かずや). Sin embargo, las dificultades económicas y de distribución terminaron provocando la interrupción de numerosas colecciones y el cierre de aquella primera etapa. La propia editorial reconoce problemas importantes entre 2008 y 2010.
Tras años de ausencia, regresó en 2022 con una nueva etapa editorial, diferenciando inicialmente entre Life Line, para a títulos actuales, y Nostalgic Line, orientada a clásicos y recuperaciones. Desde entonces, la editorial ha recuperado numerosos títulos de interés, como 17 Años (17歳), Silent Möbius (サイレントメビウス), Shin Lupin III (新ルパン三世), o Martian Successor Nadesico (機動戦艦ナデシコ).
Esta segunda etapa ha despertado tanto interés por la recuperación de obras difíciles de encontrar como críticas relacionadas con la irregularidad de los calendarios de publicación y el uso frecuente de preventas, un sistema que actualmente sigue teniendo un peso importante en su modelo de lanzamiento que la tienda mantiene bajo esta fórmula.
A pesar de esta trayectoria accidentada, MangaLine ocupa un lugar singular en la historia reciente del manga en España, tanto por algunas de las licencias que publicó durante su primera etapa como por su actual intento de recuperar obras de catálogo y ofrecer ediciones de gran formato dirigidas especialmente al lector coleccionista.